Fungicidele pentru ardei combat bolile acestei culturi. Cele mai frecvente boli ale ardeiului sunt bacteriozele, virozele si alternarioza. In special gogosarii sunt foarte sensibili la putrezirea fructelor si semintelor: Patarea frunzelor si basicarea fructelor (Xanthomonas campestris) , Putregaiul umed (Erwinia carotovora), Alternarioza (Alternaria capsici), Fainarea (Laveillula taurica), Ofilirea Vasculara (Verticillium dahliae), Caderea plantutelor. Fungicidele la ardei se aplica la avertizare sau la aparitia primelor semne de boala.